BigWig არის ფაილის ფორმატი მკვრივი, უწყვეტი მონაცემების ჩვენებისთვის გენომის ბრაუზერის ტრეკზე, შექმნილი Wiggle (WIG) ფორმატიდან კონვერტაციით. BigWig ფორმატი აღწერილია UCSC Genome Bioinformatics ვებსაიტზე და Broad Institute ფაილის ფორმატის სახელმძღვანელო გთავაზობთ დამატებით ინფორმაციას.
რა არის bigWig ფორმატი?
bigWig ფორმატი არის მკვრივი, უწყვეტი მონაცემების ჩვენებისთვის, რომლებიც ნაჩვენები იქნება როგორც გრაფიკი BigWig ფაილები თავდაპირველად იქმნება WIG ტიპის ფაილებიდან, UCSC პროგრამის wigToBigWig-ის გამოყენებით. გარდა ამისა, bigWig ფაილები შეიძლება შეიქმნას bedGraph ფაილებიდან UCSC პროგრამის bedGraphToBigWig გამოყენებით.
როგორ გამოვიყენო bigWig ფაილი?
გადაიტანეთ ახლად შექმნილი bigWig ფაილი (myBigWig.ბ.ვ) ვებ-ხელმისაწვდომ http, https, ან ftp მდებარეობაზე. ჩასვით URL მორგებული ჩანაწერის ფორმაში ან შექმენით მორგებული ტრეკი ერთი ტრეკის ხაზის გამოყენებით. ჩასვით მორგებული ჩანაწერის ხაზი ტექსტურ ველში მორგებული ტრეკის მართვის გვერდზე.
რა არის bigWig ტრეკი?
bigWig Tracks არის ტრეკები უწყვეტი სიგნალებისთვის მთელ გენომში. ისინი შესაფერისია სხვადასხვა „ნედლი“ექსპერიმენტის შედეგების საჩვენებლად, როგორიცაა ChIP-Seq სიგნალები, RNA-Seq სიგნალები და ა.შ.
როგორ შევქმნა bigWig ფაილი?
დიდი ფაილების გენერირების მრავალი გზა არსებობს. ეს ჩვეულებრივ მოიცავს კონვერტაციას. bam ფაილი wiggle ტრეკად (. wig) და შემდეგ გადაიყვანეთ wiggle ტრეკი ბინარულ bigwig-ად (.
