ყველა ამინომჟავა გვხვდება α-სპირალებში, მაგრამ გლიცინი და პროლინი იშვიათია, რადგან ისინი დესტაბილიზაციას ახდენენ α-სპირალში. გლიცინი გათავისუფლებულია მრავალი სტერული შეზღუდვისგან , რადგან მას აკლია β ნახშირბადი. … პროლაინი, მეორე მხრივ, ძალიან ხისტია.
რომელი ამინომჟავა არ არის ნაპოვნი ალფა სპირალებში?
პროლინი არ გვხვდება ცილების ალფა სპირალურ სტრუქტურაში, რადგან მას აქვს სპეციალური ციკლური სტრუქტურა (ეს არის იმინომჟავა და არა ამინომჟავა) ამ ტიპის მეორად სტრუქტურას აქვს. სპეციფიკური სიგანე და ამინომჟავების ნარჩენების კონკრეტული რაოდენობა/ბრუნი. ამიტომ პროლინი განიხილება, როგორც ალფა სპირალის ამომრთველი.
რატომ არის გლიცინი ალფა სპირალის ამომრთველი?
პროლინი და გლიცინი ზოგჯერ ცნობილია როგორც "სპირალის ამომრთველი" რადგან ისინი არღვევენ α სპირალური ხერხემლის კონფორმაციის კანონზომიერებას; თუმცა, ორივეს აქვს უჩვეულო კონფორმაციული შესაძლებლობები და ჩვეულებრივ გვხვდება მორიგეობით.
სად არის გლიცინი ალფა სპირალში?
არის სამი პოზიცია სპირალ-მობრუნება-სპირალის მოტივში, რომლებიც ძალიან კონსერვირებულია. ალანინი ჩვეულებრივ გვხვდება მე-5 პოზიციაზე პირველი α სპირალის შიგნით; გლიცინი გვხვდება პოზიცია 9, მობრუნების პირველ პოზიციაზე; და ვალინი ან იზოლეიცინი ჩვეულებრივ გვხვდება მე-15 პოზიციაზე მეორე α სპირალის შიგნით.
გვხვდება თუ არა გლიცინის ნარჩენები უპირატესად ალფა სპირალებში?
გლიცინი, თავისი მრავალი შესაძლო ძირითადი ჯაჭვის კონფორმაციით, ასევე იშვიათად გვხვდება ხვეულებში. იმის ცოდნა, თუ რამდენად სავარაუდოა ამინომჟავის წარმოქმნა ალფა სპირალში (ე.წ. სპირალის მიდრეკილება), შესაძლებელია წინასწარ განვსაზღვროთ სად წარმოიქმნება სპირალი ცილების თანმიმდევრობით.
