ახსნა: ფერმენტებს, როგორიცაა შეზღუდვის ფერმენტები, აქვთ ამოიცნონ ძალიან სპეციფიკური თანმიმდევრობა, რათა შეასრულონ მისი დავალება. ის დნმ-ს უერთდება მხოლოდ ერთ კონკრეტულ კონფიგურაციაში. … პალინდრომული თანმიმდევრობა ასევე ზრდის დნმ-ის ორივე ჯაჭვის მოჭრის შანსს.
როგორ უკავშირდება პალინდრომები შემაკავებელ ფერმენტებს?
შემზღუდავი ფერმენტები ჭრიან ორჯაჭვიან დნმ-ს კონკრეტულ ადგილებში, ამ ადგილებში ნაპოვნი ფუძეების ნიმუშის საფუძველზე. ეს ფერმენტები პროგნოზირებად ჭრიან ორივე ძაფს, რადგან მათ მიერ აღიარებული მიმდევრობებიარის პალინდრომული. ანუ ამომცნობი თანმიმდევრობები არის იდენტური ბაზების მოკლე სტრიქონი დნმ-ის ორივე ჯაჭვზე.
ყველა შემაკავებელი ფერმენტი ჭრის პალინდრომს?
შემზღუდავი ფერმენტების უმეტესობა არღვევს თავის პალინდრომულ ამოცნობის თანმიმდევრობას ასიმეტრიულად, ტოვებს ერთჯაჭვიან გადახურვას ჭრილის თითოეულ მხარეს (იხ. სურათი 4, ზემოთ). ნებისმიერ მოცემულ ფერმენტის ამოცნობის დაშლის ადგილას, ამ გადახურვებს აქვთ უნიკალური და დამატებითი თანმიმდევრობა.
ყველა შეზღუდვის საიტი პალინდრომებია?
შეზღუდვა-მოდიფიკაციის სისტემები გამოიყენება როგორც დამცავი მექანიზმი უცხო დნმ-ის შეუსაბამო შეჭრის წინააღმდეგ. საერთო ტიპის II შეზღუდვის ფერმენტების და მათი შესაბამისი მეთილაზების ამოცნობის თანმიმდევრობაა ჩვეულებრივ პალინდრომები.
რას ნიშნავს, როდესაც ფერმენტი პალინდრომიულია?
პალინდრომული თანმიმდევრობა იგივეა უკან და წინ ორივე მხარეს (იხ. სურათი ქვემოთ). ეს ნიშნავს, რომ ფერმენტი ცნობს თანმიმდევრობას, მიუხედავად იმისა, თუ რომელი მხრიდან უახლოვდება ფერმენტი დნმ-ს პალინდრომული თანმიმდევრობა ასევე ზრდის დნმ-ის ორივე ჯაჭვის მოჭრის შანსს.
