BLAST არის კომპიუტერული ალგორითმი, რომელიც ხელმისაწვდომია ონლაინ გამოსაყენებლად ბიოტექნოლოგიის ინფორმაციის ეროვნული ცენტრის (NCBI) ვებსაიტზე, ისევე როგორც ბევრ სხვა საიტზე. BLAST-ს შეუძლია დნმ-ის მოთხოვნის თანმიმდევრობის სწრაფად გასწორება და შედარება თანმიმდევრობების მონაცემთა ბაზასთან, რაც მას კრიტიკულ ინსტრუმენტად აქცევს მიმდინარე გენომის კვლევაში.
არის BLAST პირველადი მონაცემთა ბაზა?
BLAST არის ყველაზე ფართოდ გამოყენებული პროგრამული უზრუნველყოფა ბიოინფორმატიკის კვლევაში. მისი მთავარი ფუნქციაა შეადაროს ინტერესის თანმიმდევრობა, შეკითხვის თანმიმდევრობა, თანმიმდევრობებს დიდი მონაცემთა ბაზაში BLAST, შემდეგ აცნობებს მონაცემთა ბაზაში ნაპოვნი საუკეთესო შესატყვისებს, ან „ჰიტებს“. ამ მარტივ პროგრამას აქვს ორი ძირითადი პროგრამა.
არის NCBI მონაცემთა ბაზა?
NCBI შეიცავს მონაცემთა ბაზების სერიას, რომელიც ეხება ბიოტექნოლოგიისა და ბიომედიცინისდა წარმოადგენს მნიშვნელოვან რესურსს ბიოინფორმატიკის ხელსაწყოებისა და სერვისებისთვის.ძირითადი მონაცემთა ბაზები მოიცავს GenBank-ს დნმ-ის თანმიმდევრობებისთვის და PubMed, ბიბლიოგრაფიული მონაცემთა ბაზა ბიოსამედიცინო ლიტერატურისთვის. სხვა მონაცემთა ბაზები მოიცავს NCBI Epigenomics მონაცემთა ბაზას.
გამოიყენება BLAST მხოლოდ NCBI მონაცემთა ბაზაში?
BLAST ხელმისაწვდომია ინტერნეტში NCBI ვებსაიტზე. სხვადასხვა ტიპის BLAST ხელმისაწვდომია შეკითხვის თანმიმდევრობისა და სამიზნე მონაცემთა ბაზების მიხედვით.
როგორ მუშაობს BLAST მონაცემთა ბაზა?
როგორ მუშაობს BLAST? BLAST იდენტიფიცირებს ჰომოლოგიურ მიმდევრობებს ევრისტიკული მეთოდის გამოყენებით, რომელიც თავდაპირველად პოულობს მოკლე შესატყვისებს ორ მიმდევრობას შორის; ამრიგად, მეთოდი არ ითვალისწინებს მთელ მიმდევრობის სივრცეს. საწყისი მატჩის შემდეგ, BLAST ცდილობს დაიწყოს ლოკალური გასწორებები ამ საწყისი მატჩებიდან.
