SDS მტკიცედ უკავშირდება ცილების დადებითად დამუხტულ და ჰიდროფობიურ ნარჩენებს მისი სულფატური ჯგუფებისა და ალკილის ჯაჭვების მეშვეობით , შესაბამისად 13 შესაბამისად, ეს არის ღირებული სარეცხი საშუალება სტრუქტურული ბიოლოგიის და ცილების დასაკეცი/გაშლის კვლევების სფეროში.
რას უყენებს SDS ცილას?
SDS არის ამფიპათიური სურფაქტანტი. ის აცილებს ცილებს ცილოვან ჯაჭვთან შეკავშირებით მისი ნახშირწყალბადის კუდით, ავლენს ნორმალურად ჩამარხულ რეგიონებს და აფარებს ცილოვან ჯაჭვს სურფაქტანტის მოლეკულებით. SDS-ის პოლარული თავების ჯგუფი დამატებით სარგებელს მატებს ამ დენატურანტის გამოყენებას.
როგორ უკავშირდება SDS ამინომჟავებს?
სდს-ს აქვს ჰიდროფობიური კუდი, რომელიც ძლიერ ურთიერთქმედებს ცილოვან (პოლიპეპტიდურ) ჯაჭვებთან. SDS მოლეკულების რაოდენობა, რომლებიც აკავშირებენ ცილას, არის პროპორციული ამინომჟავების რაოდენობისა, რომლებიც ქმნიან ცილას თითოეული SDS მოლეკულა ხელს უწყობს ორ უარყოფით მუხტს, რაც აჭარბებს ცილას ნებისმიერი მუხტი.
ფარავს თუ არა SDS ცილებს?
SDS ასევე ფარავს ცილას ერთიანი უარყოფითი მუხტით, რომელიც ფარავს R- ჯგუფების შინაგან მუხტებს. SDS საკმაოდ თანაბრად უკავშირდება ხაზოვან პროტეინებს (დაახლოებით 1.4გ SDS/1გ ცილა), რაც იმას ნიშნავს, რომ ცილის მუხტი ახლა მისი მოლეკულური წონის დაახლოებით პროპორციულია.
როგორ აძლევს SDS პროტეინს უარყოფით მუხტს?
SDS არის სარეცხი საშუალება, რომელიც შეიცავს გრძელ ალიფატურ ჯაჭვს და სულფატულ ჯგუფს. ეს სარეცხი საშუალება ურთიერთქმედებს დენატურირებული პროტეინებთან და ქმნის ძლიერ უარყოფითად დამუხტულ კომპლექსს (უარყოფითი მუხტი წარმოიქმნება SO42 − SDS ჯგუფი). ცილები ჯერ დენატურირებულია სითბოს შედეგად და შემდეგ SDS ემატება დიდი ჭარბი რაოდენობით.
