როგორ კეთდება მეტაგენომიკა?

2024 ავტორი: Fiona Howard | [email protected]. ბოლოს შეცვლილი: 2024-01-10 06:39

მეტაგენომიკა განისაზღვრება, როგორც გენომების პირდაპირი გენეტიკური ანალიზი, რომელიც შეიცავს გარემოს ნიმუშს ველი თავდაპირველად დაიწყო გარემოს დნმ-ის კლონირებით, რასაც მოჰყვა ფუნქციური ექსპრესიის სკრინინგი [1], და შემდეგ სწრაფად დაემატა გარემოს დნმ-ის პირდაპირი შემთხვევითი თოფის თანმიმდევრობით [2, 3].

რა არის მეტაგენომიკის პროცესი?

მეტაგენომიკა მოიცავს დნმ-ის მიღებას ყველა მიკროორგანიზმიდან თემში, ყველა ჩართული სახეობის იდენტიფიცირების გარეშე. გენების თანმიმდევრობის დადგენის და იდენტიფიცირებულ თანმიმდევრობებთან შედარებით, ამ გენების ფუნქციების დადგენა შესაძლებელია.

რა ტექნიკა გამოიყენება მეტაგენომიკაში?

მიკრობული საზოგადოების ნიმუში გროვდება ზღვის წყლიდან, ნალექიდან, მასპინძელი ცხოველიდან ან ზღვის სხვა ჰაბიტატიდან.შეგროვებული უჯრედები შემდეგ ლიზდება და დნმ ამოღებულია მათი ლიზატიდან. ტექნიკა, რომელიც შესაძლებელს ხდის მეტაგენომიკას, არის თოფის თანმიმდევრობა, რომელიც ანაწილებს დნმ-ის შემთხვევით უბნებს არამიზნობრივად.

რა არის 3 ნაბიჯი მეტაგენომიკის შესწავლისთვის?

მეტაგენომიკის საფეხურები და პროცესი:

1. ნიმუშების კოლექცია:
2. დნმ-ის ექსტრაქცია:
3. ნიმუშის მომზადება:
4. ნიმუშის ანალიზი:

როგორ ხორციელდება ფუნქციური მეტაგენომიკა?

ფუნქციური მეტაგენომიკა მოიცავს დნმ-ის იზოლირებას მიკრობული თემებიდან დაშიფრული ცილების ფუნქციების შესასწავლად. იგი მოიცავს დნმ-ის ფრაგმენტების კლონირებას, გენების გამოხატვას სუროგატ მასპინძელში და ფერმენტული აქტივობის სკრინინგს.