ტრიფსინი არღვევს პეპტიდურ კავშირს კარბოქსილის ჯგუფს არგინინის ან ლიზინის კარბოქსილის ჯგუფსა და მიმდებარე ამინომჟავის ამინოჯგუფს შორის. დაშლის სიჩქარე ხდება უფრო ნელა, როდესაც ლიზინის და არგინინის ნარჩენები მჟავე ამინომჟავების გვერდით არის თანმიმდევრობით ან ცისტინით.
სად ანაწილებს ტრიპსინი ამინომჟავებს?
ტრიფსინი არღვევს პეპტიდებს ლიზინის და არგინინის ამინომჟავის ნარჩენების C-ტერმინალურ მხარეს. თუ პროლინის ნარჩენი არის დაშლის ადგილის კარბოქსილის მხარეს, გაყოფა არ მოხდება.
რა თანმიმდევრობით ჭრის ტრიპსინი?
ტრიფსინი არღვევს ექსკლუზიურად C-ტერმინალს არგინინისა და ლიზინის ნარჩენებს მასსპექტრომეტრიაზე დაფუძნებული პროტეომიკის თითქმის ყველა ფართომასშტაბიანი პროექტი იყენებს ტრიპსინს ცილოვანი ნარევების უფრო ადვილად ანალიზად პეპტიდად გადაქცევისთვის. პოპულაციები.
რა ამინომჟავებს ჭრიან ტრიპსინი და ქიმოტრიფსინი?
ტრიფსინი ამცირებს ლიზინს და არგინინს, ხოლო ქიმოტრიფსინს. წყვეტს ტიროზინს, ფენილალანინს და ტრიპტოფანს. როგორ იცის ფერმენტმა იქ გაჭრა? შესთავაზეთ ასპარტატის და ჰისტიდინის ალტერნატივა კატალიზურ ტრიადაში.
რა ამინომჟავებს ყოფს პეპსინი?
პეპსინი არღვევს პეპტიდურ ბმებს ციკლური ამინომჟავების ნარჩენების ამინოტერმინალურ მხარეს ( ტიროზინი, ფენილალანინი და ტრიპტოფანი), არღვევს პოლიპეპტიდურ ჯაჭვებს უფრო პატარა პეპტიდებად (Fange და Grove, 1979).
